В обычном режиме Windows не загружался рабочий стол - просто черный экран был и все.
Также на флешку записывалась всякая дрянь типа название_папки.exe
После проверки CureIt в безопасном режиме и удаления им вирусов, в обычном режиме все загрузилось.
Посмотрите пожалуста не осталось ли чего?